Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pls3Q99K51 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pls3Q99K51 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms