Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip2Q99JG7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms