Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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