Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms