Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp1bQ91YK2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp1bQ91YK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms