Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms