Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms