Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms