Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ8

Nprl3, GATOR complex protein NPRL3, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nprl3Q8VIJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nprl3Q8VIJ8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms