Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms