Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uba5Q8VE47 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms