Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms