Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms