Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms