Protein–RNA interactions for Protein: Q8K572

Hus1b, Checkpoint protein HUS1B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1bQ8K572 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hus1bQ8K572 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms