Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OptnQ8K3K8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms