Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms