Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms