Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abcf3Q8K268 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms