Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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