Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Lrif1Q8CDD9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrif1Q8CDD9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lrif1Q8CDD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Lrif1Q8CDD9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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