Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp20Q8C6M1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp20Q8C6M1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp20Q8C6M1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp20Q8C6M1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp20Q8C6M1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp20Q8C6M1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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