Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm9999Q8C5Y2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9999Q8C5Y2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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