Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FarsaQ8C0C7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FarsaQ8C0C7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FarsaQ8C0C7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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