Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc2Q8BZW8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms