Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec22cQ8BXT9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms