Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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