Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pggt1bQ8BUY9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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