Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn7Q8BUM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms