Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan9Q8BJU2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms