Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynprQ8BGN8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynprQ8BGN8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynprQ8BGN8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms