Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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