Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Katnb1Q8BG40 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms