Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg4cQ811C2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Atg4cQ811C2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Atg4cQ811C2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Atg4cQ811C2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4cQ811C2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atg4cQ811C2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atg4cQ811C2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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