Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NischQ80TM9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
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