Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdp1Q7TSG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms