Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms