Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trappc6aQ78XR0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Trappc6aQ78XR0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Trappc6aQ78XR0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trappc6aQ78XR0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trappc6aQ78XR0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Trappc6aQ78XR0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Trappc6aQ78XR0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6aQ78XR0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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