Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snd1Q78PY7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms