Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eci3Q78JN3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms