Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hsh2dQ6VYH9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hsh2dQ6VYH9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms