Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atl2Q6PA06 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atl2Q6PA06 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms