Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casc4Q6P2L7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casc4Q6P2L7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms