Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdcd11Q6NS46 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd11Q6NS46 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms