Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4galnt3Q6L8S8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4galnt3Q6L8S8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4galnt3Q6L8S8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B4galnt3Q6L8S8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms