Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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