Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms