Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud6aQ6IE21 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms