Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6GQU0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6GQU0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6GQU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6GQU0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6GQU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6GQU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6GQU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms