Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Carmil1Q6EDY6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Carmil1Q6EDY6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms